La pared sur es la que menos capillas cristianas posee, es la pared de la qibla, donde se encuentra el mihrab, al final del siglo XIX y durante el inicio del XX, hubo una política de eliminación de las capillas cristianas adosadas a los muros para poner en valor la construcción islámica, pero en la segunda mitad del s. XX se dieron cuenta de que se estaban eliminando buenas obras de arte de quinientos años de historia, por lo que se detuvo el desmontaje de las capillas.
En el «Centro de Información y Recepción del Patio de San Eulogio» se expone un plano muy detallado de la Mezquita-Catedral, realizado en el año 1741, donde se detallan las diversas capillas y altares dentro del templo. El lateral que ha sufrido más cambios es el sur.
En este lateral fueron varias las capillas eliminadas, se puede comparar el esquema anterior con la fotografía del plano del año 1741, se aprecia como de la 10 en el siglo XVIII, en el XXI quedan 4.
36- Sagrario; 37- San Clemente; 38- La Anunciación; 39: San Gregorio; 40- Sant Inés; 41- Sacristía Mayor; 42- La Zena; 43- San Pedro; 44- Phelie y Santiago; 45: San Bartolomé
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