El edificio que fuera “Hospital de Agudos” o “del Cardenal Salazar”, inició su construcción en 1701, patrocinado por el obispo, con la idea de crear un colegio para niños pobres a los que enseñar música y dotar así a la Catedral de una Capilla de Música, pero antes de finalizar las obras, se decide fundar aquí un hospital, dada la carencia que de centros de este tipo había en Córdoba, comenzó a recibir enfermos en 1724. El hospital pasaría a propiedad de la Diputación Provincial y su función como Hospital Provincial o de Agudos (como era conocido) la conservaría hasta el año 1969, en que se inaugura el Hospital General, en el Parque Cruz Conde, a donde se trasladan los servicios que prestaba este hospital.
Hasta el siglo XV los hospitales españoles eran pequeños, disponiendo de pocas camas y sin una estructura arquitectónica adecuada, adaptándose la mayoría a la distribución de la casa que les había sido cedida; en ellos no solo se atendían a los enfermos, sino que algunos realizaban diversos servicios asistenciales, como recogida de niños, “dementes”, etc. El primer hospital español con una estructuración hospitalaria moderna fue el “Hospital Real” fundado en Santiago de Compostela por los Reyes Católicos para dar cobijo a los peregrinos que requerían auxilio médico al finalizar el Camino. Actualmente es el Parador “Hostal de los Reyes Católicos”, en la plaza del Obradoiro.
El “Hospital del Cardenal Salazar” contó con ocho enfermerías en el piso alto junto con ocho grandes habitaciones. Como curiosidad en las contraventanas del cuerpo del patio principal en esta planta pueden verse nombres y fechas de pacientes que allí estuvieron ingresados. Algunas de ellas se remontan al siglo XVIII, pudiendo apreciarse un tipo de letra, distinto al actual.
En la parte baja tenía nueve enfermerías, doce habitaciones para sirvientes, dos cocinas una de ellas de grandes dimensiones, once patios, otras tantas fuentes, veinte celdas para enfermos mentales, una botica, dos graneros grandes y dos pequeños.
En el año 1837 se fusionan los diversos hospitales de Córdoba, según se ordenó en el Reglamento General de Beneficencia Pública que disponía la separación de los enfermos mentales en hospitales adecuados, y la ubicación de los enfermos crónicos en departamentos diferentes a los agudos, El Hospital del Cardenal fue destinado para este último tipo de enfermos, por lo tomaría el nombre de “Hospital de Agudos”. Los enfermos crónicos pasaron al Hospital “Cristo de la Misericordia”, en la “Avenida de Las Ollerías”. Desde 1853 la asistencia a los enfermos la realizaron las Hermanas de la Caridad de San Vicente de Paúl. Los enfermos psiquiátricos se ingresaron en el desamortizado convento de “San Pedro de Alcántara”.
Albergó la sede de la Facultad de Medicina de la Universidad Libre de Córdoba, institución de enseñanza universitaria fundada en 1870, que abrió sus puertas en 1874 y que, funcionó solamente cuatro años. El 21 de octubre de 1868, se publicó un decreto que decretaba la libertad docente, a la vez que declaraba: «la enseñanza es libre en todos sus grados y cualquiera que sea su clase»; por lo que se autorizaba la fundación libre de centros de enseñanza. En enero de 1869, otro decreto autorizaba a las diputaciones provinciales y a los ayuntamientos a fundar libremente con fondos propios toda clase de establecimientos de enseñanza. Al calor de este decreto surgieron diversos centros en numerosos lugares, e incluso alguna universidad, como la Libre de Córdoba, creada por la excelentísima Diputación Provincial de Córdoba por acuerdo del 15 de octubre de 1870. Comprendía las Facultades de Derecho y Medicina.
