Al sur de la Capilla de Villaviciosa, en la ampliación de Abd-al-Rahman II, se encuentra el pórtico del trascoro, en una “catedral gótica normal” este sería el primer espacio que encontraríamos a la entrada, pero aquí, ante él no se encuentra la puerta de acedo al templo.
Es obra de Hernán Ruiz III (1534-1606), fue diseñado como pórtico del coro y de la capilla mayor. Se compone de un arco de medio punto y se decora con el escudo del obispo Pablo de Laguna (1603-1006). Construye una hermosa serliana, combinación de arcos de medio punto con vanos adintelados, con un gran arco central, sobre los accesos adintelados se abren dos grandes círculos.
La calle norte-sur, previa a la serliana es una zona de tres calles en la que la arquitectura y relieves cristianos se integran en la construcción islámica de una bella forma, incluidos los pilares que se levantan para sostener la bóveda del coro. Aquí se encuentra el esucodo del obispo Leopoldo de Austria (1541-1557), hijo del emperador Maximiliano I, y por tanto tío del también emperador Carlos I.
Al pasar el arco del Pórtico, nos encontramos con el Trascoro, obra de Juan de Ochoa a principios del siglo XVII, a él abren dos puertas que comunican con el coro y lo preside una imagen de San Pedro, bendiciendo en su cátedra.
Es una obra manierista que se articúla en cinco calles separadas por pares de columnas, los huecos de las dos puertas que nos comunican con el coro se cierran con reja, y sobre el dintel frontones triangulares, en el ático un relieve de San Pedro en su cátedra.
En la nave por delante de la sirliana se puede ver el escudo del obispo Leopoldo de Austria. uno de los mayores impulsores de las obras para finalizar la construcción de la catedral en el interior de la Mezquita.
